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苹果酸舒尼替尼胶囊是一种化疗药，它可能会造成一些副作用，但因为个体存在差异性，副作用的严重程度不同。
最常见的副作用包括疲乏、食欲减退、恶心、腹泻 常见：疲劳、乏力；腹泻、腹痛、便秘、味觉改变、厌食、恶心、呕吐、黏膜炎/口腔炎、消化不良；高血压；皮疹、手足综合症、皮肤变色、出血。 潜在严重不良反应：左心室功能障碍、QT间期延长、出血、高血压和肾上腺功能。静脉血栓事件；可逆性后脑白质脑病综合症（RPLS）[高血压、头痛、灵敏性下降、精神功能改变、视力丧失]。 代谢/营养：厌食、无力 胃肠道：腹泻、便秘、恶心、呕吐、黏膜炎/口腔炎、消化不良 心血管：高血压 皮肤：皮疹、手足综合症、皮肤变色 神经系统：味觉改变 实验室检查异常：AST/ALT、脂肪酶、碱性磷酸酶、淀粉酶、总胆红素、间接胆红素、肌酐升高；低血钾、高血钠、左室射血分数下降。
副作用出现时，患者应及时与医生沟通，另外，舒尼替尼适用于甲磺酸伊马替尼治疗失败或不能耐受的胃肠间质瘤（GIST）；不能手术的晚期肾细胞癌（RCC）；不可切除的，转移性高分化进展期胰腺神经内分泌瘤（pNET）的成年患者。